总厂长办公室秘书小马在周一的上午收到四封信函。第一封是反映退休职工生活困难的长信，条理不太清楚;第二封是写着厂长亲启的信函;第三封是反映下面某分厂向河中排泄污水的举报信;第四封是某职工对住房问题的申诉信，此事有关单位已做过恰当处理并作出明确答复。请问这四封信，秘书应如何处理并说明理由。